- 大小:32.69MB
- 語(yǔ)言:簡(jiǎn)體中文
- 版本:3.6.6.17
- 更新:2025-08-26
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軟件特色介紹
SnapGene Viewer是一款質(zhì)粒圖譜繪制工具,專注于為分子生物學(xué)研究者提供基礎(chǔ)的 DNA 序列查看、注釋和共享功能。
免費(fèi)查看與注釋
用戶可免費(fèi)創(chuàng)建、瀏覽和共享注釋的 DNA 序列文件,支持質(zhì)粒圖譜的直觀展示。
內(nèi)置特征數(shù)據(jù)庫(kù),支持自動(dòng)注釋公共特性(如啟動(dòng)子、抗性基因、開放閱讀框 ORFs 等)。
跨平臺(tái)協(xié)作
支持與同事或客戶共享 SnapGene 格式的文件,促進(jìn)團(tuán)隊(duì)協(xié)作。
可導(dǎo)出為圖像(如 PNG、JPEG)或標(biāo)準(zhǔn)格式(如 GenBank、FASTQ),方便數(shù)據(jù)傳播。
可視化工具
提供多種視圖(如圖譜、序列、酶切位點(diǎn)、引物等),幫助用戶全面理解 DNA 結(jié)構(gòu)。
圖譜視圖支持環(huán)形或線性展示,標(biāo)注關(guān)鍵元件(如多克隆位點(diǎn) MCS)和酶切位點(diǎn)。
與付費(fèi)版互補(bǔ)
Viewer 版作為付費(fèi)版的補(bǔ)充,滿足基礎(chǔ)查看需求,而付費(fèi)版則提供更全面的編輯、克隆模擬和高級(jí)分析功能。
軟件功能
文件支持
導(dǎo)入格式:支持 GenBank、FASTQ、SnapGene 格式(.dna)、測(cè)序文件(.ab1、.scf)等。
導(dǎo)出格式:可導(dǎo)出為圖像(PNG、JPEG)、標(biāo)準(zhǔn)格式(GenBank、FASTQ)或 SnapGene 格式文件。
視圖與導(dǎo)航
圖譜視圖:展示質(zhì)粒的環(huán)形或線性結(jié)構(gòu),標(biāo)注關(guān)鍵元件和酶切位點(diǎn),支持縮放和細(xì)節(jié)查看。
序列視圖:顯示詳細(xì)的 DNA 序列,支持搜索特定序列或注釋,并可編輯(僅付費(fèi)版支持)。
酶切位點(diǎn)視圖:列出所有限制性內(nèi)切酶的識(shí)別位點(diǎn),支持按數(shù)量或存在性篩選,深色標(biāo)記單一位點(diǎn),淺色標(biāo)記多位點(diǎn)。
引物視圖:展示已設(shè)計(jì)的引物信息,如位置、GC 含量、Tm 值等,支持引物比對(duì)和驗(yàn)證。
注釋與編輯
自動(dòng)注釋:識(shí)別公共特性(如 ORFs、啟動(dòng)子)并標(biāo)注,減少手動(dòng)操作。
手動(dòng)注釋:允許用戶自定義特性(如基因、UTR),調(diào)整顏色和標(biāo)簽以增強(qiáng)可讀性。
引物設(shè)計(jì):支持設(shè)計(jì) PCR、測(cè)序或誘變引物,并標(biāo)注在序列上,付費(fèi)版支持引物模擬和驗(yàn)證。
分析與模擬
序列比對(duì):支持多序列比對(duì)(DNA 或蛋白質(zhì)),選擇算法(如 Clustal Omega、MAFFT),生成比對(duì)結(jié)果和統(tǒng)計(jì)報(bào)告。
翻譯預(yù)測(cè):顯示可能的編碼區(qū),支持調(diào)整參數(shù)以預(yù)測(cè)非編碼 RNA(如 lncRNA、circRNA)。
電泳模擬:模擬限制酶切消化或 PCR 擴(kuò)增的結(jié)果,生成虛擬凝膠圖像,輔助實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。
數(shù)據(jù)管理
搜索與過濾:快速定位特定序列、酶或引物,支持關(guān)鍵詞搜索和高級(jí)過濾。
歷史記錄:跟蹤所有編輯和操作,支持撤銷和重做,確保數(shù)據(jù)可追溯。
批量處理:對(duì)多個(gè)文件執(zhí)行相同操作(如格式轉(zhuǎn)換、注釋統(tǒng)一),提高工作效率。
小編寄語(yǔ)
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